La Dirección de Pesquería, es autoridad inmediata al Director Regional de la Producción, en la Dirección de su competencia, está encargado de formular, ejecutar, supervisar la política relativa a la Dirección de Pesquería, las mismas que comprende las actividades de extracción y procesamiento, acuicultura marina y continental, velando por la explotación racional y preservación del medio ambiente en la Región Moquegua.

• Funciones acreditadas en materia de Pesquería:
• Formular, aprobar, ejecutar, evaluar, dirigir, controlar y administrar los planes y políticas en materia pesquera y producción acuícula de la región.
• Administrar, supervisar y fiscalizar la gestión de actividades y servicios pesqueros bajo la jurisdicción regional.
• Desarrollar acciones de vigilancia y control para garantizar el uso sostenible de los recursos hidrobiológicos de la región Moquegua.
• Promover la previsión de recursos financieros privados a las empresas y organizaciones de la región, con énfasisen en las medianas, PYMES y unidades productivas orientadas a la exportación.
• Desarrollar e implementar sistemas de información y poner a disposición de la población información útil referida a la gestión del sector.
• Promover, controlar y administrar el uso de los servicios de infraestructura de desembarque y procesamiento pesquero de su competencia en armonía con las polñiticas y normas del sector, a excepcióin del control y vigilancia de las normas sanitarias sectoriales en todas las etapas de las actividades pesqueras.
• Promover la investigación e información acerca de los servicios tecnológicos para la preservacióny protección del medio ambiente.
• Velar y exigir el adecuado cumplimiento de las normas técnicas en materia de pesquería.  Dictar las medidas correctivas y sancionar de acuerdo con los dispositivos legales vigentes.