La finalidad de la Gerencia Regional de la Producción de la Región Moquegua, es promover el desarrollo de las actividades de extracción, transformación y acuicultura de recursos hidrobiológicos marinos y de aguas continentales, así como las actividades productivas, entendiéndose como tales a las de industrialización, procesamiento, y de manufactura, comprendidas dentro del ámbito Regional, con beneficio para la población y contribución al desarrollo sostenible del país.
La misión de la Gerencia Regional de la Producción de la Región Moquegua, es promover y fomentar la productividad y competitividad de las actividades pesqueras, acuícolas e industriales, tanto para el consumo interno como externo, manteniendo un enfoque de uso racional de los recursos, protección del medio ambiente, beneficio para la población y contribución al desarrollo sostenible de la Región Moquegua y del país.